Red de especies y especímenes

La REyE se concibe como un sistema descentralizado de proveedores de datos, en el cual, la información es mantenida y controlada por la institución o persona que la administra, por lo que un componente clave es la existencia de un punto de acceso centralizado a los recursos integrados de la red. Este punto de acceso será implementado por medio de un portal (ver figura 1). El portal permitirá que los usuarios de Internet encuentren en un solo lugar y de forma gratuita e integrada información de de especies y especímenes de las Américas que se encuentra distribuida en instituciones alrededor del mundo.

El portal de acceso integrado está siendo desarrollado por el Sistema Mundial de Información sobre Biodiversidad (GBIF) con el objetivo de integrar información de especímenes y es denominado el “GBIF Customizable Portal” y la REyE ha colaborado extendiendo su funcionalidad de forma que permita la integración y despliegue de información de especies.

La REyE está utilizando actualmente para el intercambio de información con los proveedores de datos, los protocolos DiGIR y TAPIR (implementación TapirLink. La información viaja entre los proveedores y el portal en formato Darwin Core o ABCD para estandarizar datos de especímenes y en formato Plinian Core para estandarizar información de especies.

Adicionalmente, la REyE está desarrollando, para las instituciones que no cuentan con herramientas de apoyo para la digitalización de información, una herramienta de software para proveer a las instituciones e investigadores de los países miembros de la red de un mecanismo para almacenar y procesar, de manera digital, la información sobre especies y especímenes que administran. Esta herramienta de software se denomina Herramienta de captura.

Para desarrollar los sistema se utilizan plataformas y herramientas Open Source (o de código abierto) como: Java Entreprise Edition, PostgreSQL, MySQL, Hibernate, Sun Application Server, Apache Tomcat, Eclipse y Maven, entre otras herramientas.

Materiales de apoyo:

El usuario puede acceder al sitio de forma anónima para realizar consultas, utilizando el usuario invitado con la contraseña invitado.

Código de las aplicaciones:

Para la administración del código de las aplicaciones la REyE utiliza Subversion o SVN. El SVN es una herramienta de software para controlar versiones, desarrollado por el proyecto tigris. Es muy utilizado por los programadores de comunidades que trabajan de manera distribuida, para mantener centralizado el código que es desarrollado (más información).

En el caso de la REyE será el mecanismo utilizado para que instituciones o personas interesadas puedan acceder al código fuente de los desarrollos. Para conectarse y descargar el código de este repositorio existen una gran cantidad de clientes, algunos se integran a los IDE (Entornos de Desarrollo Integrado) de programación y otros funcionan como aplicaciones en el sistema operativo utilizado (más información ).

El código del portal se encuentra en: svn://200.91.89.228/IABIN-SSTN y el código de la herramienta de captura se encuentra en http://fornax.inbio.ac.cr/ara/

Comunidad de desarrolladores o capacitadores:
El objetivo de la comunidad es establecer un mecanismo de comunicación entre los miembros con el fin de realimentar y proveer de material de apoyo a las personas interesadas en realizar capacitaciones nacionales o regionales en el uso de las herramientas, permitir que los participantes hagan sugerencias a la documentación de análisis y diseño, soliciten mejoras a los sistemas y reporten el mal funcionamiento de las herramientas, entre otras acciones.

Guía para la implementación de los talleres nacionales.
Reportes de solicitudes de cambio y mal funcionamiento de los sistemas: Portal y Herramienta de captura
Documentos de análisis y diseño de las herramientas y foro para las consultas
(El usuario puede acceder al sitio de forma anónima utilizando el usuario invitado con la contraseña invitado).
Comunidad regional de desarrolladores